Машины БЭСМ-6 стояли во всех ведущих научных центрах и Центральном статистическом управлении. А в 1975 г. вычислительный комплекс на основе БЭСМ-6 использовался для расчетов, связанных с советско-американской космической программой «Союз—Апполон». Всего было выпущено 355 таких машин.
На этом компьютере создавали машинно-генерируемую музыку, которую неискушенная аудитория не могла отличить от написанной человеком. Именно на БЭСМ-6 впервые было выполнено моделирование, показавшее, что после ядерной войны наступит «ядерная зима». Это внесло важный вклад в ядерное сдерживание